Сравнительный анализ содержания микроэлементов в первично фосфатоносных палеозойских и вторичных гипергенных породах (кальциевофосфатные, алюмофосфатные и железофосфатные, включая охру фосфатную) Софроновского месторождения показал повышение содержания в последних Zn, As, Cd, Co и понижение Mo, V, Cr, Rb, Ta, а, относительно содержания фосфора, также и РЗЭ. При этом для кальциевофосфатных пород наиболее характерны повышенные содержания халькофильных элементов (Zn, Cd), для алюмофосфатных - литофильных (Sc, Ba, Sr, РЗЭ), для железофосфатных - сидерофильных (Ni, Co), но также и Zn. Содержание Zn в гипергенных кальциевофосфатных породах месторождения достигает весьма высоких значений (5900 г/т), что отвечает повышенным его содержаниям для аналогичных пород других регионов, и для этих образований данный элемент может считаться типоморфным. Экологическая оценка возможности использования фосфоритной муки на базе фосфоритов Софроновского месторождения в качестве удобрения показала, что для большинства элементов возможный срок их использования применительно к почвам юга Сибири исчисляется от сотен до десятков тысяч лет, и лишь для F - десятками лет.